And en and bij PubMed

De booleaanse operatoren in de zoekstrategieën bij Pubmed worden gewoonlijk altijd met hoofdletters geschreven. In veel gevallen is dat niet nodig, als je and typt in plaats van AND vind je evenveel records:

Search Most Recent Queries Time Result
#6 Search child NOT asthma 03:35:21 1407372
#5 Search child not asthma 03:35:13 1407372
#4 Search child OR asthma 03:35:04 1520182
#3 Search child or asthma 03:34:56 1520182
#2 Search child AND asthma 03:34:47 30187
#1 Search child and asthma 03:34:36 30187

Maar in sommige gevallen moet je echt wel hoofdletters gebuiken.

Bijvoorbeeld als je de zoekstrategie wilt bewaren in myNCBI. Als je dan ‘and’ gebruikt, maakt PubMed er een stopwoord van, en zoekt naar “… AND and AND …”. Het resultaat is dan 0 hits.

Bij sommige termen ziet pubMed ‘and’ als onderdeel van een MeSH term.
Het gebruik van ‘and’ geeft ook problemen wanneer je tags gebruikt in je search, maar bij OR en NOT met kleine letters trouwens niet:

Search Most Recent Queries Time Result
#6 Search child[mh] NOT asthma[mh] 03:43:18 1282584
#5 Search child[mh] not asthma[mh] 03:43:10 1282584
#4 Search child[mh] OR asthma[mh] 03:43:03 1371954
#3 Search child[mh] or asthma[mh] 03:42:53 1371954
#2 Search child[mh] AND asthma[mh] 03:41:26 25847
#1 Search child[mh] and asthma[mh] 03:41:04 0

Bij child[mh] and asthma[mh] wordt de search vertaald in “and asthma[mh]”. En er is geen “and asthma” MeSH heading.

Op de help-pagina van PubMed staat het volgende: Enter Boolean operators in uppercase characters to combine or exclude search terms. Maar in het NLM Technical bulletin uit 2007 staat het wat genuanceerder. Citaat:

Question:

What is the correct way to search in PubMed using Boolean operators? Should they be capitalized?

Answer:

Most PubMed searches do not require Boolean operators to be in uppercase characters. The system recognizes both Boolean OR and NOT in either lower or uppercase. However, lowercase Boolean AND is processed as a stopword rather than a Boolean operator because it is sometimes embedded in MeSH Terms and Subheadings. When you search with a lowercase Boolean AND, click the Details tab to see how the search is translated, e.g., breast cancer and therapy is translated so that and becomes AND. Processing lowercase and as a stopword works well for most PubMed queries that simply include search terms; however queries that include search tags or search history numbers may require an uppercase AND. See the two examples that include a search tag below:

For example:

breast cancer AND therapy[sh] successfully translates to: ((“breast neoplasms”[TIAB] NOT Medline[SB]) OR “breast neoplasms”[MeSH Terms] OR breast cancer[Text Word]) AND “therapy”[Subheading]

breast cancer and therapy[sh] fails to translate correctly because the system searches for the complete phase in the subheading field.

Please note that the majority of searches (especially those that do not user search tags or search numbers) do NOT require the Boolean AND, therefore, breast cancer therapy is the recommended format. The Details feature will show you how PubMed translates the search.

Misschien aan de eindgebruiker toch alleen maar het gebruik van hoofdletters aanleren?

Eén reactie to “And en and bij PubMed”

  1. Dymphie Says:

    Ja, dat is wel een goed idee,
    Ik adviseer het altijd want er zijn meer databases waar dat een rol bij speelt.
    Geeft ook beter overzicht.

Geef een reactie

Vul je gegevens in of klik op een icoon om in te loggen.

WordPress.com logo

Je reageert onder je WordPress.com account. Log uit / Bijwerken )

Twitter-afbeelding

Je reageert onder je Twitter account. Log uit / Bijwerken )

Facebook foto

Je reageert onder je Facebook account. Log uit / Bijwerken )

Google+ photo

Je reageert onder je Google+ account. Log uit / Bijwerken )

Verbinden met %s


%d bloggers op de volgende wijze: