PubMed Limits

Op de ClinLib-lijst werd deze week een merkwaardig fenomeen over de Limits-functie van PubMed rondgestuurd. Deze zou niet correct werken.
Zelf werk ik niet zo veel met Limits, alleen na afloop van een search om in de tijd te beperken tot de laatste paar jaar. Verder kun je je via Limits beperken tot een bepaalde leeftijdscategorie, soort publicatie e.d., maar er is ook een pull-down menu waarin Field Tags kunnen worden geselecteerd. Standaard staat deze op All Fields, maar je kunt elk veld kiezen, dat door Medline wordt geïndexeerd.
Nu blijkt dat als je deze Field Tag aanzet na afloop van de search deze niet goed werkt voor de Field Tag Title/Abstract. Je krijgt een heel ander resultaat vergeleken met zoeken als deze Field Tag aanstaat, zie tabelletje hieronder. Het verschil is zo’n 800 records.

Search Most Recent Queries Time Result
#7 Search #5 and #6 Field: Title/Abstract 02:27:11 1439
#6 Search survivor or survivor* Field: Title/Abstract 02:26:51 48150
#5 Search childhood cancer Field: Title/Abstract 02:26:35 7248
#4 Search #1 and #2 Field: Title/Abstract 02:25:39 2215
#3 Search #1 and #2 02:25:15 2215
#2 Search survivor or survivor* 02:22:45 52653
#1 Search childhood cancer 02:22:24 28037

Mogelijk dat dit voor meerdere velden opgaat, bij de Limiet op tijd heb ik nog geen vreemde dingen gezien.

Het probleem met Limieten is een beetje dat je niet altijd in de gaten hebt dat er een limit op zit. Sinds de laatste update van PubMed staat dit netjes op alle schermen vermeld, dus dat helpt een heleboel.
Zelf zou ik de limiet voor Field Tags niet gebruiken, maar direct in de zoekbalk erbij zetten dat je in alleen title/abstract wilt zoeken, b.v. Childhood cancer[tiab]. Dan zie je meteen wat je aan het doen bent.
Maar ook dan krijg je een andere opbrengst vergeleken met het gebruik van de Field Tags:

Search Most Recent Queries Time Result
#14 Search #13 and #12 02:48:34 1141
#12 Search survivor[tiab] or survivor*[tiab] 02:47:37 48150
#11 Search survivor[tiab] or survivor*[tiab] Field: Title/Abstract 02:47:24 48150
#10 Search childhood cancer[tiab] Field: Title/Abstract 02:46:36 3331

Vergelijk maar eens de opbrengst van #10 of #13 met die van #5 uit de vorige tabel: gebruik van de Field Tag Title/Abstract geeft in dit voorbeeld ruim twee keer zoveel records dan zoeken met [tiab]. Het wordt weer eens tijd om PubMed om opheldering te vragen.

Geef een reactie

Vul je gegevens in of klik op een icoon om in te loggen.

WordPress.com logo

Je reageert onder je WordPress.com account. Log uit / Bijwerken )

Twitter-afbeelding

Je reageert onder je Twitter account. Log uit / Bijwerken )

Facebook foto

Je reageert onder je Facebook account. Log uit / Bijwerken )

Google+ photo

Je reageert onder je Google+ account. Log uit / Bijwerken )

Verbinden met %s


%d bloggers op de volgende wijze: