Archive for the ‘Uit het nieuws’ Category

Fans van PubMed

2011/04/22

In een vorig bericht heb ik een paar tweet-berichten aangehaald, waarvan de auteur zich behoorlijk negatief over PubMed uitliet, zonder verder op de reden hiervan uit te weiden. Al deze hate-tweets worden trouwens worden verzameld op een website. Een link daarnaartoe vond ik in een tweet van 18 april j.l.: “#hate #pubmed ? 34 people agree. More on Pubmed page: http://j.mp/1jRXvA?”
Als je even goed kijkt staat er onder aan de pagina nog een link naar positieve berichten over PubMed. Gelukkig zijn er andere mensen die niet zo negatief reageren. En uiteraard kan PubMed altijd beter en anders.

Advertenties

EBM hooglereaar

2011/04/01

Sinds 22 maart j.l. bebben we een officiële EBM hoogleraar. Rob Scholten, directeur van het Dutch Cochrane Center, hield toen zijn oratie getiteld ‘Hoe sterk is het eenzame bewijs‘. In zijn rede ging hij uitgebreid in op de problemen die tijdens het schrijven van systematische reviews naar voren komen: onvolledige publicaties, niet gepubliceerd onderzoek, de industrie die gegevens achterhoudt, en het opzetten van trial registers, waar tegenwoordig nieuw onderzoek bij moet worden aangemeld.
Zeer beknopt ging hij in wat we de komende jaren van zijn leerstoel mogen verwachten: reviews uiteraard, verbeteringen in het traject om tot publicatie te komen, openbaarmaken van alle onderzoeksgegevens.

TED.com

2011/02/18

Deze week heb ik een fascinerend fimpje gezien van TED, een mij tot dan toe onbekende  organisatie. Via de Amerikaanse medbib-lijst, dr. Shock blog kwam ik uiteindelijk bij TED terecht  Titel van het fimpje is Vizualizing the medical data explosion. Als informatiepsecialist wordt je alleen al door die titel getriggerd.

Eigenlijk gaat het niet over bibliotheken, maar over de dataexplosie die door de medische wereld zelf wordt veroorzaakt. Als een patiënt door de scan wordt gehaald zoals dat populair heet, krijg je een vracht aan gegevens, die allemaal verwerkt moeten worden. Om deze data draait het. De wijze waarop de visualisatie plaats vindt met behulp van een reuze ipad, heel interessant om dat te zien. Toepassing van het scannen om virtueel autopsies uit te voeren, zonder dat daar een mes aan te pas komt: mooie toepassing. Tot slot werd getoond hoe real time de hersenen van een proefpersoon in de scan op opdrachten van buiten reageren. Deze persoon kon in de scan ook z’n eigen hersenactiviteit waarnemen. Fascinerend. Deze film duurt ongeveer 15 minuten, en is uitereaard ook te vinden op de TED website

Alerts

2011/02/11

Ik heb naast RSS, nog een paar ‘ouderwetse’ e-mail alerts lopen om geattendeerd te worden op nieuwe publicaties op ons vakgebied: het zoeken naar informatie. Afgelopen week zaten er een paar aardige titels tussen, die ik hier wil noemen.

Patient safety and systematic reviews: finding papers indexed in MEDLINE, EMBASE and CINAHL.
Tanon AA, Champagne F, Contandriopoulos AP, Pomey MP, Vadeboncoeur A, Nguyen H.
Qual Saf Health Care. 2010 Oct;19(5):452-61. Epub 2010 May 10.

PubMed and beyond: a survey of web tools for searching biomedical literature.
Lu Z.
Database (Oxford). 2011 Jan 18;2011:baq036. Print 2011.

The evidence-based medicine advisor’s challenge: mentoring and critiquing students’ PubMed search methods.
Archambault ME.
J Physician Assist Educ. 2010;21(3):33-9.

PubMed searching for home care clinicians: a guide for success in identifying articles for a literature review.
Young JS.
Home Healthc Nurse. 2010 Oct;28(9):559-65; quiz 566-7.

Evaluating the impact of MEDLINE filters on evidence retrieval: study protocol.
Shariff SZ, Cuerden MS, Haynes RB, McKibbon KA, Wilczynski NL, Iansavichus AV, Speechley MR, Thind A, Garg AX.
Implement Sci. 2010 Jul 20;5:58.

Ik moet ze zelf nog doornemen, dat is me door alle drukte van de laatste tijd nog niet gelukt.

Rest me nog te melden dat het commentaar op Winchester & Bavry, waarover ik eerder meldde, ook in gedrukte vorm wordt verspreid. Volgende week in de Annals of Internal Medicine. Zo vlot  als de electronsiche versie werd gepubliceerd (binnen een paar uur), zo traag gaat de papieren versie (5 maanden).


Goodbye PubMed, hello raw data

2011/01/28

Onder deze titel publiceerde de BMJ op 12 januari j.l. een editorial van Fiona Godley, editor van de BMJ. Een pakkende titel zeker voor medisch informatiespecialisten, die dagelijks in PubMed zoeken.
Al jaren pleit de Cochrane Collaboration voor openheid van gegevens voor klinische studies. Een eerste stap in de goede richting was het verplicht stellen door de belangrijke medische tijdschriften van een trial nummer, ISRCTN (International Standard Randomised Controlled Trial Number Register). Alle nieuwe trials krijgen zo’n nummer (of zouden zo’n nummer moeten krijgen). Het register waar al deze trials in te vinden zijn is ondergebracht bij de WHO, en voor een ieder toegankelijk en doorzoekbaar.

Fiona Godley gaat in haar stuk nog verder: al het onderzoeksmateriaal, dat tijdens een studie wordt aangemaakt, alle gegevens van patiënten, bijwerkingen, moet ter beschikking komen van auteurs die een systematische review willen schrijven. Zij deed haar oproep naar aanleiding van het weerbarstige gedrag van Roche wat betreft het gebruik van oseltamivir (Tamiflu), een neuramidase remmer, als behandeling om geen griep te krijgen en om de symptomen van griep te verminderen. Aanleiding voor haar editorial was een update van een Cochrane review over griepvaccinatie en het gebruik van neuramidase remmers bij gezonde volwassenen., en een publicatie in BMJ (Jefferson et al) over de moeilijkheden die de Cochrane auteurs hebben ondervonden om alle data boven water te krijgen, en wat dus uiteindelijk niet is gelukt.
Er bleek slechts één onderzoek beschikbaar (met incomplete gegevens en uitgevoerd in opdracht van Roche) dat positieve data beschreef over Tamiflu. In hun update hebben de auteurs daarom hun conclusie over Tamiflu herroepen, die eigenlijk gebaseerd was op dit ene incomplete artikel. Herhaaldelijke verzoeken aan de auteurs van het Tamiflu artikel mochten niet baten. Ook herhaalde verzoeken aan Roche, het bedrijf dat Tamiflu maakt, leverden niet op.
Het zou dus heel goed kunnen dat de werking van Tamiflu op lucht is gebouwd. Roche wil geen opening van zaken geven, het enige positieve artikel over Tamiflu is door Roche gesponsord, en hierin zijn niet alle trialgegevens in verwerkt.
Godley pleit er dan ook voor dat altijd alle onderzoeksgegevens verplicht beschikbaar moeten komen: “Reviewers must assess entire trial programmes, and so new tools and methods are needed.” Voor auteurs van systematische reviews zal dat aanzienlijk meer werk opleveren.

Delicious houdt er helemaal niet mee op

2011/01/21

In tegenstelling tot een eerder bericht op dit blog een maand geleden over het einde van Delicious, blijkt nu dat deze dienst er helemaal niet mee stopt.
Via de medbib lijst kwam gisteren een bericht langs van de Delicious Customer Support, dat meteen alle berichten omtrent het einde van Delicious ontkracht. Citaat: “Thank you for writing to Delicious.
I understand that you have heard rumors about Yahoo! shutting down Delicious and want to take a backup of your Delicious bookmarks. We’re genuinely sorry to have these stories appear with so little context for our loyal users.
No, we are not shutting down Delicious. While we have determined that there is not a strategic fit at Yahoo!, we believe there is a ideal home for Delicious outside of the company where it can be resourced to the level where it can be competitive.
We promise to keep you posted as future plans get finalized and encourage you to check the Delicious blog for the latest updates: http://blog.delicious.com

Als je dan toch van Delicious af wilt. Naast Diigo, zijn er nog meer opties voor het opslaan via het web van belangrijke websites, nl. Google Bookmarks (niet zo’n hanfige tool om bookmarks te importeren), Pinboard, en PearlTrees.com. Pinboard vraagt een fee, vooral om spam te voorkomen, en om de site in de lucht te houden. De voors en tegens om over te stappen van Delicious naar Pinboard wordt uitgebreid uit de doeken gedaan.

Information overload

2010/12/22

In het kerstnummer van BMJ staat een editorial van Richard Smith over hoe om te gaan met het teveel aan informatie: Strategies for coping with information overload. Het is een commentaar en aanvulling op een artikel dat is geschreven door Fraser and Dunstan: On the impossibility of being expert. Vooral de laatste zin uit de editorial is aardig:

“Will we ever solve the problem of information overload?” I imagine myself asking God as I arrive in heaven. “Sure,” he’ll answer, “but not in my lifetime.”

.

E-content

2010/12/03

In hoeverre e-readers al gemeengoed zijn binnen de medische bibliotheken van Nederland weet ik niet. De openbare bibliotheken zijn er al druk mee bezig. Lees de NEDBIB berichten maar.
In het laatste nummer van JEAHIL werd door Oliver Obst aandacht besteed aan het uitlenen van iPads in de bibliotheek van Münster. Er is trouwens een interessante blog over “eBooks, audio books, and other digital content found in libraries as well as the technology needed to read and listen to this digital content”: No shelf required.

PubMed nieuws

2010/12/01

PubMed heeft een nieuw aardigheidje: miniplaatjes of wel thumbnails bij sommige abstracts. Het gaat vooralsnog om PubMed Central® articles. Het gaat om afbeeldingen uit de full text. De figuren worden geplaatst in de  National Center for Biotechnology Information (NCBI) Images database, die binnenkort wordt vrijgegeven. Bekijk het complete bericht uit het NLM bulletin.

Obesitas

2010/11/26

Gisteren stond het op de voorpagina van NRC Handelsblad: obesitas is een chronische, ongeneeslijke ziekte. Jarenlange behandeling is nodig om gewichtsvermindering te bewerkstelligen en om een gezondere leefwijze te bevorderen en te behouden. Dit staat in de deze week uitgekomen Zorgstandaard Obesitas.
Dit is uiteraard geen goed nieuws: jarenlang mensen helpen om van hun overgewicht af te komen. En als dat niet lukt: obesitas leidt tot een verhoogde kans op diabetes, gewrichtsproblemen, en hart- en vaatziekten.
Ook hebben mensen met obesitas een verhoogd risico op het verkrijgen van een aantal types kanker. De blog Onco’Zine besteedde hier deze week ook aandacht aan, met een verwijzing naar een wat “alternatieve” blog van een zekere dr. Su, met als titel Carbohydtrates can kill.
In elk geval geldt dat het voorkomen van obesitas beter is dan genezen.